旌阳区卫生健康局成立于2019年，由原旌阳区卫生和计划生育局整合老龄工作、职业安全健康监督管理职责组建而成。主要职责为：贯彻落实党中央关于卫生健康工作的方针政策和省委、市委、区委的决策部署，指导全区卫生健康工作，牵头推进深化医药卫生体制改革，指导规范卫生行政执法行为，负责全区疾病预防控制、医疗机构及医疗服务行业监督管理、公共卫生、妇幼健康、计划生育管理和服务等工作。

旌阳区卫生健康局设内设机构11个：办公室（信访办）、人事与科教股、规划财务与信息统计股、政策法规与体制改革股、医政医管股（卫生应急办公室）、中医股、公共卫生股、综合监督股、人口监测与家庭发展股、爱国卫生与健康促进股、机关党委。辖区中医院、区妇幼保健计划生育服务中心、区疾病预防控制中心3家区级医疗卫生机构，镇卫生院10个，社区卫生服务中心9个，村卫生站106个，卫生所4个，医务室9个，社会办医疗机构329家，监狱医院3家。截至2024年底，区属公立医疗卫生机构共有职工2091人，专业技术人员共1909人，其中，正高职称37人，副高职称164人，中级职称708人。

近年来，旌阳区卫生健康局牢固树立大卫生、大健康理念，以改革创新为动力，以促健康、转模式、强基层、重保障为着力点，把以治病为中心转变到以人民健康为中心，为人民群众提供全方位全周期卫生健康服务，卫生健康工作取得可喜成绩：医药卫生体制改革成效显著，健康扶贫成果不断巩固，医疗服务能力持续提升，公共卫生服务体系不断完善，卫生健康支撑保障全面加强。成功创建全国基层中医药工作先进县、省级健康促进区、省级慢性病综合防控示范区，顺利通过四川省血吸虫病消除达标评估。旌西社区卫生服务中心顺利通过社区医院省级验收，泰山社区卫生服务中心被评为“全国优质服务示范社区卫生服务中心”，区疾控中心荣获四川省抗击新冠肺炎疫情先进集体、先进基层党组织称号，区卫健局获得四川省“五一”劳动奖状、四川省卫生健康系统先进集体、德阳市脱贫攻坚先进集体、德阳市抗疫先锋等称号。聂春萍荣获全国抗击新冠肺炎疫情先进个人、全国卫生健康系统新冠肺炎疫情防控工作先进个人。